自動パッチクランプはパッチクランプ技術に革命をもたらしました。これまでネックとなっていた高度な技術が不要となり、大幅なスループットの向上が可能となりました。本技術では、従来のマニュアルパッチクランプで使用されていた微小なガラスキャピラリーの代わりに、平面上のホウケイ酸ガラスチップを使用し、この平面上のガラスチップに微小な穴をあけることにより、キャピラリーの代わりとして使用します。精密な陰圧のコントロールが可能なサクションコントロールユニットを使用することで、ガラスチップの穴に単一の細胞を捕らえ、細胞とガラスチップの間に高抵抗シール（ギガオームシール）を形成します。マニュアルパッチクランプと同じ素材のガラスを使用しているため、測定データは非常に高い相関を示します。複数の細胞を同時に測定することも可能なため、簡単にスループットを向上することができ、またマニュアルパッチでは難しい細胞内液灌流も可能です。