自动膜片钳技术彻底改革了膜片钳技术。它消除了传统膜片钳技术所需的复杂操作，显著提高了实验的通量。这项技术采用平面芯片代替传统的玻璃微电极。通过在平面芯片上打孔，利用精确的负压控制单元，可以在芯片孔中捕获单个细胞，并在细胞膜与芯片孔之间形成高电阻封接。由于自动膜片钳使用了与传统膜片钳相同材质的玻璃，测量数据显示出极高的相关性。通过同时记录多个细胞，自动膜片钳的通量可以得到显著提高。此外，更换细胞内液等还可以在自动膜片钳上得到实现。